MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-04

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005005	A	6	6	55	60	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005005	TA	3	6	1068	1073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005005	TTA	2	6	1134	1139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005005	CCT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_005005	CT	3	6	3109	3114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005005	T	6	6	3114	3119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005005	TTG	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005005	TTATA	2	10	3223	3232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005005	TA	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005005	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005005	A	6	6	3866	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005005	TAG	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005005	AAT	3	9	3893	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005005	A	6	6	3921	3926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005005	ACTT	2	8	3943	3950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_005005	AATT	2	8	3951	3958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005005	TTG	2	6	4031	4036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005005	TTA	2	6	4039	4044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005005	TAA	2	6	5021	5026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005005	GAT	2	6	5068	5073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005005	AT	4	8	5077	5084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005005	A	7	7	5097	5103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005005	TA	3	6	5104	5109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005005	TTA	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005005	TA	3	6	5211	5216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005005	GATA	2	8	5310	5317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005005	ATAG	2	8	5338	5345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005005	ATG	2	6	5361	5366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005005	AAAT	2	8	5367	5374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005005	GGT	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005005	CA	3	6	6204	6209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_005005	TTG	2	6	6221	6226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005005	ATC	2	6	6258	6263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_005005	A	7	7	6283	6289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005005	ATC	2	6	6504	6509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_005005	AAATA	2	10	6534	6543	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005005	T	6	6	6557	6562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005005	TCA	2	6	6574	6579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_005005	TA	3	6	6621	6626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005005	TTC	2	6	6648	6653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_005005	ATT	2	6	6678	6683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005005	A	6	6	6691	6696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005005	A	7	7	6717	6723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005005	AGA	2	6	6749	6754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005005	AT	3	6	7890	7895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005005	ATTT	2	8	7921	7928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005005	T	6	6	7967	7972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005005	A	7	7	7985	7991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005005	ATCA	2	8	7998	8005	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_005005	TAA	3	9	8062	8070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005005	ATAA	2	8	8952	8959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005005	TTA	2	6	8971	8976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005005	TC	3	6	8994	8999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_005005	AAT	2	6	9028	9033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005005	TAAT	2	8	9720	9727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005005	CAA	2	6	9764	9769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_005005	CCT	2	6	10390	10395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_005005	AT	4	8	10490	10497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005005	AG	3	6	10510	10515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005005	CT	3	6	10544	10549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_005005	TATAT	2	10	10553	10562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005005	T	7	7	10576	10582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005005	AAC	2	6	10585	10590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005005	TTA	2	6	10633	10638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005005	ATG	2	6	10662	10667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005005	ATT	2	6	10686	10691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005005	CTTC	2	8	10723	10730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_005005	TAT	2	6	10752	10757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005005	ATAA	2	8	10781	10788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005005	ATACTC	2	12	10797	10808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_005005	TA	3	6	10809	10814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005005	AAC	2	6	10829	10834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_005005	TAAT	2	8	11479	11486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005005	GA	3	6	11493	11498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005005	T	6	6	12962	12967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005005	AGA	2	6	13404	13409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005005	TAA	2	6	13414	13419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005005	AT	4	8	13440	13447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005005	TA	3	6	13449	13454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005005	A	6	6	13456	13461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005005	TATT	2	8	13496	13503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005005	ATAA	2	8	13506	13513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005005	ATTC	2	8	13519	13526	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_005005	AGTAA	2	10	13527	13536	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005005	TG	3	6	13564	13569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005005	AT	3	6	13596	13601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005005	ACGT	2	8	13607	13614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_005005	ATT	2	6	13626	13631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005005	T	6	6	13630	13635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005005	ATATA	2	10	13649	13658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005005	AT	3	6	13696	13701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005005	TAT	2	6	13712	13717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005005	ATA	2	6	13740	13745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005005	ATG	2	6	15628	15633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005005	AAC	2	6	15642	15647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_005005	ATA	2	6	15655	15660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005005	GTT	2	6	15672	15677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005005	TTG	2	6	15753	15758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005005	TAA	2	6	15766	15771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005005	TA	3	6	15823	15828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005005	A	6	6	15834	15839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005005	ACAA	2	8	15874	15881	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_005005	AAGA	2	8	15894	15901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005005	AAAC	2	8	15902	15909	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_005005	A	7	7	15934	15940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005005	TATTAA	2	12	15950	15961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005005	A	6	6	15960	15965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005005	TTA	2	6	16000	16005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005005	CTTT	2	8	16047	16054	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_005005	CTA	2	6	16151	16156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_005005	AGT	2	6	16223	16228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005005	ATT	2	6	16270	16275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005005	TTTA	2	8	16283	16290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005005	AAC	2	6	16302	16307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_005005	CTA	2	6	16321	16326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_005005	CCT	2	6	16374	16379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_005005	GTTA	2	8	16385	16392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005005	ACG	2	6	16408	16413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_005005	TATAT	2	10	16419	16428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005005	TA	3	6	16478	16483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005005	ATA	2	6	16501	16506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005005	ATTTTA	2	12	16513	16524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005005	TAC	2	6	16550	16555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_005005	A	6	6	17157	17162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005005	AAG	2	6	17179	17184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005005	A	7	7	17217	17223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005005	AAAAT	2	10	17236	17245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.